1. Επιληψία. Το πρότυπο των νευρικών κυμάτων των επιληπτικών ασθενών είναι πολύ διαταραγμένο κατά τη διάρκεια του ΗΕΓ και το ΗΕΓ μπορεί να χρησιμοποιηθεί για τη διάγνωση της επιληψίας.
2. Εγκεφαλοαγγειακή νόσος. Το ΗΕΓ μπορεί να ελέγξει την εγκεφαλική αιμορραγία, την εγκεφαλική θρόμβωση, το έμφραγμα του εγκεφάλου και άλλες εγκεφαλοαγγειακές παθήσεις.
3. Εγκεφαλίτιδα, όγκος εγκεφάλου, εγκεφαλική βλάβη. Το ΗΕΓ μπορεί να ανιχνεύσει το μη φυσιολογικό φαινόμενο της εγκεφαλικής λειτουργίας, το οποίο είναι χρήσιμο για τη διάγνωση της εγκεφαλίτιδας, του όγκου του εγκεφάλου και της εγκεφαλικής βλάβης.
4. Σχιζοφρένεια, μανιοκατάθλιψη, ψύχωση. Το ΗΕΓ μπορεί να αναγνωρίσει και να διαγνώσει τη σχιζοφρένεια, τη μανιοκατάθλιψη και την ψύχωση.
5. Δηλητηρίαση. Η εξέταση ΗΕΓ μπορεί να ανιχνεύσει δηλητηρίαση από μονοξείδιο του άνθρακα, αλκοολισμό, δηλητηρίαση από φάρμακα κ.λπ., και να καθορίσει τη σοβαρότητα της νόσου.